《透明男与人类女～不久成为夫妇的二人～》讲述了一个发生在未来都市中的奇幻爱情故事。背景设定在一个科技高度发达的世界，隐形人技术逐渐普及，人类社会与透明存在的生物共存，但两者间的感情交流依然充满挑战和误解。

故事的主人公是透明人艾伦，他因一次实验事故获得了半透明的身体状态，无法完全融入人类社会。女主角玲子是一名普通的人类女孩，性格开朗且富有同情心。两人在一次偶然的邂逅中相识，玲子对艾伦的异样状态表现出极大的理解和包容，逐渐解开了彼此内心的孤独与恐惧。

随着关系的发展，艾伦与玲子面临来自社会和自身的各种考验。重要转折点是艾伦的一次身体状态失控，险些曝光身份，导致双方关系陷入危机。高潮部分表现为双方克服障碍，坦诚面对彼此的情感，最终决定携手步入婚姻。结局温馨感人，象征着跨越界限的真挚爱情和未来无限可能。